MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009484	TCC	2	6	131547	131552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259139
3002	NC_009484	GGC	2	6	131560	131565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259139
3003	NC_009484	CGG	2	6	131574	131579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259139
3004	NC_009484	GAT	2	6	131591	131596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259139
3005	NC_009484	CGC	2	6	131645	131650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259139
3006	NC_009484	CCG	2	6	131665	131670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259139
3007	NC_009484	GCATC	2	10	131680	131689	20 %	20 %	20 %	40 %	148259139
3008	NC_009484	GCCCGA	2	12	131740	131751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259139
3009	NC_009484	GGT	2	6	131821	131826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259139
3010	NC_009484	AGGC	2	8	131860	131867	25 %	0 %	50 %	25 %	148259139
3011	NC_009484	GGC	2	6	131875	131880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259139
3012	NC_009484	GCC	2	6	131919	131924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259139
3013	NC_009484	CG	3	6	132007	132012	0 %	0 %	50 %	50 %	148259139
3014	NC_009484	GCC	2	6	132060	132065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259139
3015	NC_009484	TCG	2	6	132084	132089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259139
3016	NC_009484	GGCG	2	8	132118	132125	0 %	0 %	75 %	25 %	148259139
3017	NC_009484	CCG	2	6	132133	132138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259139
3018	NC_009484	GAT	2	6	132151	132156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259139
3019	NC_009484	GTC	2	6	132164	132169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259139
3020	NC_009484	GC	3	6	132176	132181	0 %	0 %	50 %	50 %	148259139
3021	NC_009484	CGG	2	6	132292	132297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259139
3022	NC_009484	AGC	2	6	132476	132481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3023	NC_009484	GCG	2	6	132534	132539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259140
3024	NC_009484	CCAG	2	8	132543	132550	25 %	0 %	25 %	50 %	148259140
3025	NC_009484	CCAGC	2	10	132558	132567	20 %	0 %	20 %	60 %	148259140
3026	NC_009484	AGC	3	9	132581	132589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3027	NC_009484	AAT	2	6	132594	132599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259140
3028	NC_009484	ATC	2	6	132626	132631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259140
3029	NC_009484	CGAG	3	12	132667	132678	25 %	0 %	50 %	25 %	148259140
3030	NC_009484	GCC	2	6	132703	132708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259140
3031	NC_009484	CGGC	2	8	132719	132726	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3032	NC_009484	CGT	2	6	132735	132740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3033	NC_009484	GC	3	6	132747	132752	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3034	NC_009484	CGC	2	6	132760	132765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259140
3035	NC_009484	GCC	2	6	132811	132816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259140
3036	NC_009484	CGG	3	9	132822	132830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259140
3037	NC_009484	GAA	2	6	132877	132882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259140
3038	NC_009484	GC	3	6	132903	132908	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3039	NC_009484	CGG	2	6	132912	132917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259140
3040	NC_009484	CG	3	6	132962	132967	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3041	NC_009484	CAG	2	6	133045	133050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3042	NC_009484	GCGCC	2	10	133056	133065	0 %	0 %	40 %	60 %	148259140
3043	NC_009484	GGCT	2	8	133111	133118	0 %	25 %	50 %	25 %	148259140
3044	NC_009484	CGC	3	9	133122	133130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259140
3045	NC_009484	GCA	2	6	133131	133136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3046	NC_009484	CGC	2	6	133159	133164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259140
3047	NC_009484	TCG	2	6	133202	133207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3048	NC_009484	CAG	2	6	133246	133251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3049	NC_009484	TCG	2	6	133283	133288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3050	NC_009484	CG	3	6	133287	133292	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3051	NC_009484	GAT	2	6	133300	133305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259140
3052	NC_009484	GCCG	2	8	133325	133332	0 %	0 %	50 %	50 %	148259140
3053	NC_009484	GCA	2	6	133374	133379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3054	NC_009484	CAG	2	6	133399	133404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259140
3055	NC_009484	CGG	2	6	133474	133479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3056	NC_009484	CGGG	2	8	133518	133525	0 %	0 %	75 %	25 %	148259141
3057	NC_009484	GAA	2	6	133558	133563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259141
3058	NC_009484	CG	3	6	133598	133603	0 %	0 %	50 %	50 %	148259141
3059	NC_009484	TCA	2	6	133604	133609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259141
3060	NC_009484	GGC	3	9	133693	133701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3061	NC_009484	CGC	2	6	133775	133780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259141
3062	NC_009484	AGCA	2	8	133797	133804	50 %	0 %	25 %	25 %	148259141
3063	NC_009484	GCG	2	6	133879	133884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3064	NC_009484	GTCGGC	2	12	133903	133914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259141
3065	NC_009484	GGC	2	6	133938	133943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3066	NC_009484	TGACGA	2	12	133949	133960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148259141
3067	NC_009484	CTT	2	6	133983	133988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259141
3068	NC_009484	TCC	2	6	134038	134043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259141
3069	NC_009484	GCG	2	6	134051	134056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3070	NC_009484	TCG	2	6	134062	134067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259141
3071	NC_009484	GCG	2	6	134098	134103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3072	NC_009484	GCT	2	6	134106	134111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259141
3073	NC_009484	CG	3	6	134148	134153	0 %	0 %	50 %	50 %	148259141
3074	NC_009484	CCGC	2	8	134183	134190	0 %	0 %	25 %	75 %	148259141
3075	NC_009484	CGG	2	6	134225	134230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259141
3076	NC_009484	GC	3	6	134246	134251	0 %	0 %	50 %	50 %	148259141
3077	NC_009484	ACC	2	6	134299	134304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259141
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3079	NC_009484	CGA	2	6	134408	134413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259141
3080	NC_009484	CCGG	2	8	134438	134445	0 %	0 %	50 %	50 %	148259141
3081	NC_009484	TCG	2	6	134446	134451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259141
3082	NC_009484	GC	3	6	134460	134465	0 %	0 %	50 %	50 %	148259141
3083	NC_009484	GAA	3	9	134482	134490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259141
3084	NC_009484	GCT	2	6	134493	134498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259141
3085	NC_009484	TGCC	2	8	134501	134508	0 %	25 %	25 %	50 %	148259141
3086	NC_009484	GAGT	2	8	134652	134659	25 %	25 %	50 %	0 %	148259142
3087	NC_009484	TC	3	6	134691	134696	0 %	50 %	0 %	50 %	148259142
3088	NC_009484	CCG	2	6	134720	134725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259142
3089	NC_009484	GGCC	2	8	134737	134744	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3090	NC_009484	CTC	3	9	134763	134771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259142
3091	NC_009484	CG	3	6	134814	134819	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3092	NC_009484	ATC	2	6	134874	134879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259142
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3097	NC_009484	CGGC	2	8	134971	134978	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3098	NC_009484	CGG	2	6	135002	135007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259142
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3100	NC_009484	TGGG	2	8	135037	135044	0 %	25 %	75 %	0 %	148259142
3101	NC_009484	CGG	2	6	135061	135066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259142
3102	NC_009484	TCG	2	6	135115	135120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259142
3103	NC_009484	CTG	2	6	135135	135140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259142
3104	NC_009484	TGC	2	6	135169	135174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259142
3105	NC_009484	TCCT	2	8	135216	135223	0 %	50 %	0 %	50 %	148259142
3106	NC_009484	GCC	2	6	135244	135249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259142
3107	NC_009484	GCC	2	6	135294	135299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259142
3108	NC_009484	CGC	2	6	135348	135353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259142
3109	NC_009484	GGC	2	6	135355	135360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259142
3110	NC_009484	CGC	2	6	135365	135370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259142
3111	NC_009484	CCT	2	6	135412	135417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259142
3112	NC_009484	TCG	2	6	135418	135423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259142
3113	NC_009484	CG	3	6	135429	135434	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3114	NC_009484	CTT	2	6	135506	135511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259142
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3117	NC_009484	GCG	2	6	135608	135613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259142
3118	NC_009484	CG	5	10	135612	135621	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3119	NC_009484	GC	3	6	135669	135674	0 %	0 %	50 %	50 %	148259142
3120	NC_009484	GCCA	2	8	135825	135832	25 %	0 %	25 %	50 %	148259143
3121	NC_009484	TCG	2	6	135835	135840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259143
3122	NC_009484	CGG	2	6	135845	135850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259143
3123	NC_009484	TCG	2	6	135883	135888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259143
3124	NC_009484	GC	3	6	135889	135894	0 %	0 %	50 %	50 %	148259143
3125	NC_009484	CGG	2	6	135899	135904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259143
3126	NC_009484	GGC	2	6	135939	135944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259143
3127	NC_009484	GTC	2	6	135969	135974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259143
3128	NC_009484	GTC	2	6	136015	136020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259143
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3133	NC_009484	GCC	2	6	136188	136193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259144
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3135	NC_009484	TCG	2	6	136322	136327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259144
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3137	NC_009484	CCATG	2	10	136415	136424	20 %	20 %	20 %	40 %	148259144
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3145	NC_009484	GCC	2	6	136762	136767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259144
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3154	NC_009484	CG	3	6	137062	137067	0 %	0 %	50 %	50 %	148259144
3155	NC_009484	CCT	2	6	137106	137111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259144
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3226	NC_009484	GGC	2	6	139806	139811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259147
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3228	NC_009484	TCCA	2	8	139896	139903	25 %	25 %	0 %	50 %	148259147
3229	NC_009484	CG	3	6	139974	139979	0 %	0 %	50 %	50 %	148259147
3230	NC_009484	GCG	3	9	139984	139992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259147
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3232	NC_009484	GTCA	2	8	140055	140062	25 %	25 %	25 %	25 %	148259147
3233	NC_009484	CGC	2	6	140087	140092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
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3235	NC_009484	CAG	2	6	140158	140163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3236	NC_009484	GCA	2	6	140217	140222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3237	NC_009484	CCG	2	6	140234	140239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
3238	NC_009484	CGC	2	6	140323	140328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
3239	NC_009484	GCC	2	6	140354	140359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
3240	NC_009484	GGC	2	6	140389	140394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259148
3241	NC_009484	CCT	3	9	140430	140438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259148
3242	NC_009484	GCC	2	6	140448	140453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
3243	NC_009484	GAGC	2	8	140466	140473	25 %	0 %	50 %	25 %	148259148
3244	NC_009484	GCA	2	6	140532	140537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3245	NC_009484	CGGGC	2	10	140553	140562	0 %	0 %	60 %	40 %	148259148
3246	NC_009484	GCA	2	6	140565	140570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3247	NC_009484	GCC	2	6	140580	140585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259148
3248	NC_009484	CGA	2	6	140590	140595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259148
3249	NC_009484	CG	3	6	140606	140611	0 %	0 %	50 %	50 %	148259148
3250	NC_009484	CGT	2	6	140640	140645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259148
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3255	NC_009484	TGA	2	6	140874	140879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259148
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3259	NC_009484	TGC	2	6	141030	141035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259148
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3262	NC_009484	GCG	2	6	141100	141105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
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3266	NC_009484	CGG	2	6	141239	141244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
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3269	NC_009484	TGC	2	6	141283	141288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259149
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3274	NC_009484	CGG	2	6	141377	141382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259149
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3330	NC_009484	CGCGAT	2	12	143370	143381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3331	NC_009484	GAT	2	6	143388	143393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259150
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3334	NC_009484	GCT	2	6	143478	143483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3335	NC_009484	CTG	2	6	143527	143532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
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3348	NC_009484	ATC	2	6	144199	144204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259150
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3350	NC_009484	ATC	2	6	144307	144312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259150
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3353	NC_009484	CCGGCA	2	12	144365	144376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148259150
3354	NC_009484	GC	3	6	144398	144403	0 %	0 %	50 %	50 %	148259150
3355	NC_009484	ATCTTC	2	12	144466	144477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148259150
3356	NC_009484	GCA	2	6	144487	144492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259150
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3358	NC_009484	TCG	2	6	144626	144631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259150
3359	NC_009484	ACCG	2	8	144646	144653	25 %	0 %	25 %	50 %	148259150
3360	NC_009484	CCG	2	6	144665	144670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259150
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3362	NC_009484	TGG	2	6	144733	144738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259150
3363	NC_009484	CGG	2	6	144758	144763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259150
3364	NC_009484	GA	3	6	144835	144840	50 %	0 %	50 %	0 %	148259150
3365	NC_009484	CGG	2	6	144964	144969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
3366	NC_009484	GACC	2	8	144994	145001	25 %	0 %	25 %	50 %	148259151
3367	NC_009484	CGG	2	6	145014	145019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
3368	NC_009484	CGG	2	6	145027	145032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259151
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3472	NC_009484	CG	3	6	148966	148971	0 %	0 %	50 %	50 %	148259153
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3476	NC_009484	CG	3	6	149205	149210	0 %	0 %	50 %	50 %	148259153
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3484	NC_009484	CGAGCA	2	12	149677	149688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259153
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3487	NC_009484	CGG	2	6	149777	149782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259153
3488	NC_009484	GCA	2	6	149803	149808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259153
3489	NC_009484	CGG	2	6	149848	149853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259153
3490	NC_009484	AGC	2	6	149955	149960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259153
3491	NC_009484	GC	3	6	149959	149964	0 %	0 %	50 %	50 %	148259153
3492	NC_009484	TTGCG	2	10	149996	150005	0 %	40 %	40 %	20 %	148259153
3493	NC_009484	TG	3	6	150072	150077	0 %	50 %	50 %	0 %	148259153
3494	NC_009484	TG	3	6	150141	150146	0 %	50 %	50 %	0 %	148259153
3495	NC_009484	CGGC	2	8	150163	150170	0 %	0 %	50 %	50 %	148259153
3496	NC_009484	CCG	2	6	150174	150179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259153
3497	NC_009484	CGT	2	6	150339	150344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259153
3498	NC_009484	GCG	2	6	150372	150377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259153
3499	NC_009484	AAC	2	6	150432	150437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259153
3500	NC_009484	GAC	2	6	150575	150580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259153

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